惠来二中的历史可以追溯到1950年，当时成立的学校名为“惠来县人民中学惠来分教处”。经过两年的变迁，1952年，学校更名为“惠来中学”。紧接着在1953年，学校正式更名为“惠来县第二中学”，这一名称一直沿用至今。

1958年，惠来二中的教育层次得以提升，首次招收高中一年级学生，成为一所集初中和高中于一体的全日制完全中学，这在当时是学校的里程碑式发展。

1986年，随着靖海地区学生数量的激增，靖海镇中学应运而生，填补了当地高中教育的空白，惠来县的教育格局也因此初具规模。

1999年，陈汉生校长的到来为惠来二中带来了显著的变化。在他的领导下，学校蓬勃发展，高中部成绩显著，2005年，独立的高中部门“惠来宝喜高级中学”在葛山设立，进一步提升了学校的教育质量。

2024年是惠来二中的高光时刻，无论是初中中考还是高中高考，学校都取得了前所未有的佳绩，陈汉生校长因此成为学校历史上的一个重要角色。同年，陈汉生晋升为惠来一中的校长，而黄金松接任了惠来二中的校长一职，继续引领学校迈向新的发展阶段。