细胞结构差异、生物特征区别、分类学归属等原因。

1、细胞结构差异：蓝细菌和细菌在细胞结构上存在明显的差异。蓝细菌没有成型细胞核、核膜和核仁，细菌有成型细胞核。

2、生物特征区别：蓝细菌是一类能进行光合作用的藻类，有类似植物的特征。含有叶绿素和类囊体，能够利用光能进行光合作用。

3、分类学归属：分类学的原则，蓝细菌和细菌被归类到原核生物的不同类别。蓝细菌属于原核生物中的藻类，细菌属于原核生物中的其他类别。