山东大学与山东大学威海校区的毕业证书编号在本质上是一样的，但在具体位置上有所不同。这意味着，两校的毕业证书在外观上具有高度的一致性，如封皮设计、证书格式、校长签名以及印章等都保持一致。

尽管如此，毕业证书编号的排列顺序却有所区别。例如，编号的位置可能在证书的不同区域，或者编号的组成方式存在细微差异。这种差异虽然细微，但在证书的识别过程中却起到了关键作用。因此，即便毕业证书编号相同，也难以通过编号本身区分两校的毕业证书。

值得注意的是，山东大学威海校区作为山东大学的分校之一，其毕业证书在设计上充分体现了母校的规范和要求。因此，从宏观上看，这两校的毕业证书在外观上几乎无异。但这种一致性并不意味着可以忽略编号位置和顺序的差异，因为这些细节是区分两校毕业证书的关键。

总结来说，山东大学与山东大学威海校区的毕业证书编号虽然相同，但在具体位置和顺序上存在差异。这种差异在实际应用中起到了重要的区分作用，确保了每一本毕业证书的唯一性和正确性。