广东海洋大学分布在三个校区，包括主校区、霞山校区和海滨校区，但寸金学院校区不在其中。总面积达到4911亩。主校区坐落在湛江市西郊的湖光岩风景区附近，依山傍海，环境优美，是理想的学术之地。

主校区内设有多个学院，涵盖了水产学院、食品科技学院、农学院、工程学院、经济管理学院、航海学院、信息学院、软件学院、理学院、文学院、法学院、中歌艺术学院、外国语学院、政治与行政学院、继续教育学院和职业技术学院。其中，寸金学院作为独立学院也设有相关课程。

学校专业设置丰富，提供本科专业59个，高职高专专业29个，研究生教育方面，拥有硕士学位授权点14个，以及农业推广硕士学位点。在学科建设上，学校有省级重点学科1个，省级重点扶持学科2个，广东省名牌专业2个。

在科研机构方面，学校设有广东省海洋开发研究中心、水产病原生物学及流行病学重点实验室、水产品深加工重点实验室、珍珠研究所、海洋经济研究所、南海海洋环境研究所等18个科研平台，为学术研究和技术创新提供了坚实的支撑。