内蒙古农业大学和内蒙古科技大学都是位于中国的高等学府，分别拥有独特的学科优势和办学特色。内蒙古农业大学自2001年起成为国家西部大开发“一省一校”重点支持建设的大学，随后在2024年成为国家林业局和自治区人民政府共建的高校，并于2013年进入国家“中西部高等教育振兴计划”支持院校行列。学校设有22个院部，拥有10个博士后科研流动站、13个一级学科博士学位授权点和24个一级学科硕士学位授权点，学科涵盖范围广泛。内蒙古农业大学在教育部第四轮学科评估中，食品科学与工程学科获评B，林学获评C+，农学获评C-。这些数据表明，内蒙古农业大学在农林领域的学科建设方面具有较强的竞争力。

相比之下，内蒙古科技大学则坐落于包头市，这是一座首批全国文明城市，被誉为草原上的钢铁之城。学校在1998年划归内蒙古自治区管理，2000年内蒙古煤炭工业学校并入，2003年更名为内蒙古科技大学。内蒙古科技大学设有20个教学单位，拥有4个一级学科博士学位授权点、18个一级学科硕士学位授权点和12个专业硕士学位授权领域，本科专业数量为66个。内蒙古科技大学在教育部第四轮学科评估中，冶金工程获评B-，矿业工程获评C-，这也显示了其在工科领域的研究实力。

综合来看，尽管两所院校都是普通高校，内蒙古农业大学的办学规模更大，拥有一级学科博士学位授予权。内蒙古农业大学不仅拥有10个博士后科研流动站和13个一级学科博士学位授权点，还在教育部第四轮学科评估中，食品科学与工程、林学和农学三个学科的表现更为突出。这表明内蒙古农业大学在整体办学实力方面更胜一筹。

基于这些分析和个人见解，个人认为内蒙古农业大学在办学实力和学科建设方面更为优秀。