这个谜语所指的生肖是“兔”。

这个谜语“中间隔着三三恋，今期三六正有码”看似晦涩，但实际上蕴含了巧妙的数字游戏和对生肖的隐喻。首先，我们来解析谜语中的数字部分。

“中间隔着三三恋”可以理解为两个三之间有所关联。在传统文化和谜语中，三常常与生肖中的某些动物有特定联系。而“今期三六正有码”中的“三六”，如果我们将它理解为数字相加，即三加六等于九。在十二生肖的排列中，第九位正是“兔”。

进一步探究，“三三恋”可能指的是某种重复或循环的模式，而“三六”相加得到的九，不仅是数字上的和，也可能暗示着一种完满或循环的结束，这与生肖十二年一个循环的概念相呼应。在这个循环中，第九个位置上的“兔”，成为了这个谜语所指的答案。

此外，“兔”这个生肖在文化中常常与温柔、敏捷和幸福联系在一起。谜语通过一种富有诗意和隐晦的方式，引导我们去思考和寻找答案，最终揭示出“兔”这个生肖，也带给人们一种解谜后的喜悦和满足感。

综上所述，通过对谜语中数字和生肖关系的细致分析，我们可以确定这个谜语所指的生肖是“兔”。这个过程不仅是对语言文字的一种巧妙运用，也是对传统文化和生肖知识的一种有趣探索。