核酸中的碱基分为两大类：嘌呤碱与嘧啶碱。它们都是含氮的杂环化合物，因此被称为碱基或含氮碱。核酸中的碱基主要有腺嘌呤（A）、鸟嘌呤（G）、胞嘧啶（C）、尿嘧啶（U）与胸腺嘧啶（T）。在RNA与DNA中，A、G与C为共同碱基成分，而DNA含T，RNA含U。

嘌呤与嘧啶在生理pH条件下通常以酮式存在，但它们具有酮-烯醇式互变异构现象。某些核酸包含修饰或稀有碱基，这些碱基多是通过在嘌呤或嘧啶碱特定部位进行甲基化或其他化学修饰而形成。例如，某些DNA分子可能含有5-甲基胞嘧啶（m5C）或5-羟甲基胞嘧啶（hm5C），某些RNA分子可能含有1-甲基腺嘌呤（m1A）、2，2-二甲基鸟嘌呤（m22G）以及5，6-二氢尿嘧啶（DHU）等。

碱基在核酸分子中起着至关重要的作用。它们以特定方式配对，如A与T，G与C，形成双螺旋结构。这种配对规则使得DNA能够进行复制与转录。碱基的序列决定了遗传信息的编码与表达。因此，理解碱基的类型与性质对于生物分子学、遗传学与分子生物学的研究至关重要。