蓝藻是原核生物,又叫蓝绿藻 蓝细菌；大多数蓝藻的细胞壁外面有胶质衣,因此又叫粘藻.在所有藻类生物中,蓝藻是最简单、最原始的一种.蓝藻是单细胞生物,没有细胞核,但细胞中央含有核物质,通常呈颗粒状或网状,染色质和色素均匀的分布在细胞质中.该核物质没有核膜和核仁,但具有核的功能,故称其为原核（或拟核）.在蓝藻中还有一种环状DNA——质粒,在基因工程中担当了运载体的作用.和细菌一样,蓝藻属于“原核生物”.

蓝藻不具叶绿体、线粒体、高尔基体、中心体、内质网和液泡等细胞器,唯一的细胞器是核糖体.

蓝藻的繁殖方式有两类,一为营养繁殖,包括细胞直接分裂（即裂殖）、群体破裂和丝状体产生藻殖段等几种方法,另一种为某些蓝藻可产生内生孢子或外生孢子等,以进行无性生殖.孢子无鞭毛.目前尚未发现蓝藻有真正的有性生殖.

蓝藻是最早的光合放氧生物,对地球表面从无氧的大气环境变为有氧环境起了巨大的作用.有不少蓝藻（如鱼腥藻）可以直接固定大气中的氮（原因：含有固氮酶,可直接进行生物固氮）,以提高土壤肥力,使作物增产.还有的蓝藻为人们的食品,如著名的发菜和普通念珠藻（地木耳）、螺旋藻等.