光绪三年十二月初二日(1878年1月4日)，西征军肃清和田之敌，取得完全胜利，收复了除伊犁外的全部新疆地区。左宗棠也因此由一等恪靖伯晋为二等恪靖侯。 　　左宗棠随即致力于收复伊犁。 　　时清廷派崇厚出使俄国谈判归还伊犁事，及《里瓦几亚条约》成，失地丧权，举国震怒。 　　左宗棠愤然说：“武事不竞之秋，有割地求和者矣；兹一矢未闻加遗，乃遽议捐弃要地，餍其所欲，譬犹投犬以骨，骨尽而噬仍不止。目前之患既然，异日之忧何极？此可为叹息痛恨者矣！”审时度势，他认为只靠外交必不能收回伊犁，应“先之口舌，继以兵戎，事无不济”。 　　于是，在曾纪泽赴俄重开谈判时，左宗棠在新疆备战。 　　光绪六年(1880年)春，左宗棠定出三路进兵伊犁之策。 　　同年四月十八，左宗棠携棺木出关西征，以示与沙俄决一死战。 　　甫抵哈密，左宗棠忽获廷旨，谕其立即回京，“以备朝廷顾问”。左宗棠保荐刘锦棠继任督办新疆军务。 　　次年正月，曾纪泽谈判后，签署《中俄改订条约》(即《中俄伊犁条约》)，中国收回了伊犁和特克斯河上游两岸领土。 　　左宗棠在新疆注意兴修水利、筑路、屯田、植树等等，建议以新疆建省，意义深远。后人曾写诗称赞：“大将筹边尚未还，湖湘子弟满天山。新栽杨柳三千里，引得春风渡玉关。” 　　收复新疆后，左宗棠曾专门到福建林则徐祠拜谒，在林公像前默默悼念。 　　他写了幅对联：“三吴颂遗爱，鲸浪初平，治水行盐，如公皆不朽；卅载接音尘，鸿泥偶踏，湘间邗上，今我复重来。” 　　左公柳 左宗棠两次率部西征，一路进军，一路修桥筑路，沿途种植榆杨柳树。不出几年工夫，从兰州到肃州，从河西到哈密，从吐鲁番到乌鲁木齐，凡湘军所到之处所植道柳，除戈壁外，皆连绵不断，枝拂云霄，这就是被后人所称的“左公柳”。