接第一部，陈永仁（梁朝伟）死后，刘建明（刘德华）开始在警队里大洗底，纷纷干掉以前一起潜伏到警队里的韩琛（曾志伟）的卧底，并且干掉了他的老大韩琛，想以此安安心心地做他心里一直想做的那个好人。此时陈道明（大陆派去协助香港警方调查警队内鬼的卧底）伤好（第一部里，码头那场戏，挟持陈永仁，结果被黎明在腿上打了一枪而没打头）归队，继续与杨锦荣（黎明）联手调查警队里韩琛的卧底。而由于杨锦荣是香港警局保安科科长（相当于大陆公安部内的政治部主任，有对内调查权和情报搜集获取权，权力很高，其它部门无权调查及干涉），以前与韩琛有过交涉，之间的对话内容被杨锦荣录了音，而杨锦荣一直怀疑刘建明是警队里的内鬼，但一直没有证据，所以杨锦荣故意将他与韩琛的谈话录音剪辑后泄露给刘建明，使得刘建明以为杨锦荣是韩琛安插到警队里的最后一个内鬼（当然除了他自己以外），所以刘建明回到调查科以后就一直把自己锁到办公室里秘密调查杨锦荣，殊不知他已经被杨锦荣给下了套，将自己是内鬼的马脚一步步展露出来，而刘建明以前与韩琛交换情报时所录音的磁带也被杨锦荣在刘建明办公室里的保险箱中找到（证据终于到手，杨锦荣也开始行动了）。在最后一场戏里，刘建明拿着以为是证据的录音带（其实已被杨锦荣给掉了包，是刘建明自己与韩琛谈话的录音带）带人去抓杨锦荣时，我们就看到了最后的那一幕，杨锦荣中枪倒地，刘建明自杀未成，全部三部曲也就over了！而陈永仁、杨锦荣、刘建明三人都是当年同时进的警队，如果当年陈永仁不走的话，警队第一名也不会被杨锦荣拿到（这是杨锦荣自己说的，码头火拼那场戏），所以说，他们三人从进警队的第一天，各自的命运就已经被联到了一起！这也从另一个方面回应了导演所要表达的含义和主题！

我靠！一下子打了这么多字，楼主这回应该能看懂了吧！看的时候最好三部一起连着看，这样你就能看明白的！！