绝大多数蜥蜴都是吃各种昆虫、小动物的，它们基本上以昆虫、蚯蚓、蜗牛，甚至老鼠等为食。但这不是绝对的，和它们的生活环境和种类有关系，有的蜥蜴还吃植物，如鬣蜥以植物为主。仅存的海生种为加拉帕戈斯群岛）的海鬣蜥，食海藻。有几种蜥蜴部分水栖，食淡水生物。

蜥蜴的食物也和当地的食物来源和习性有关系，如壁虎类夜晚活动，以鳞翅目等昆虫为食物。体型较大的蜥蜴如大壁虎（蛤蚧）也可以小鸟，其他蜥蜴为食物。巨蜥则可吃鱼、蛙甚至捕食小型哺乳动物。更有科莫多龙巨型还吃野生牛，各种大型动物都是它们的食物，它们是该地区的食物链顶端的动物。

活动摄食

蜥蜴是变温动物，在温带及寒带生活的蜥蜴于冬季进入休眠状态，表现出季节活动的变化。在热带生活的蜥蜴，由于气候温暖，可终年进行活动。但在特别炎热和干燥的地方，也有夏眠的现象，以度过高温干燥和食物缺乏的恶劣环境。

可分为白昼活动、夜晚活动与晨昏活动三种类型。不同活动类型的形成，主要取决于食物对象的活动习性及其他一些因素。