三本学生与二本学生毕业后都可以获得毕业证书，但是两者之间的区别还是比较明显的：

1.学历：二本毕业生所获得的学位是学士学位，而三本毕业生所获得的学位是大专学位。

2.学制：二本的学制通常是4年，而三本的学制则为3年。

3.学费：因为学制的差异，三本所花费的学费一般要比二本低一些。

4.职业发展：用人单位对于学士学位的要求比较高，因此二本毕业生的就业竞争力要比三本毕业生大。

综上所述，三本和二本的毕业证书在学历上有着很大的差别，而且二本的学制长，学费贵，但职业发展机会也更加广阔，所以在选择高等教育时需要根据个人的实际情况作出权衡。