南通理工学院在多个领域提供了高质量的专业教育。机电工程学院的数控技术和机电一体化技术专业致力于培养具备现代机械制造技术与自动化控制知识的高素质技术技能人才。这些专业的课程内容涵盖了机械设计、电子技术、计算机辅助设计与制造等方面，为学生提供了全面的技术训练。

新能源工程系的生物技术及应用专业则聚焦于生物技术在能源领域的应用，包括生物质能、生物燃料等。该专业结合了生物学、化学和工程学的知识，旨在培养能够从事生物能源开发、生物材料制造等工作的专业人才。

电子信息工程技术专业则面向信息技术产业的发展需求，旨在培养具备电子技术、信息技术和计算机技术综合应用能力的技术技能人才。该专业的课程包括电路设计、嵌入式系统开发、网络技术等，为学生提供了扎实的专业基础。

汽车工程学院的汽车制造与装配技术和汽车检测与维修技术专业则侧重于汽车制造与维修领域。这些专业通过理论与实践相结合的教学方法，使学生掌握汽车制造、装配、检测及维修的技术技能。

软件工程系的计算机应用技术专业则专注于计算机软硬件的应用与开发，旨在培养具备软件开发、系统集成与管理能力的技术技能人才。该专业的学生将学习到计算机编程、数据库管理、网络系统等知识。

经济管理学院的会计与审计专业则面向现代企业管理的需求，旨在培养具备会计、审计及相关财务管理知识的专业人才。该专业的课程内容涵盖了会计核算、财务管理、审计实务等方面，为学生提供了全面的管理技能训练。