《越狱》第四季第五集第九集的剧情主要围绕着林肯·布鲁斯和迈克尔·斯科菲尔德兄弟俩的逃亡生活展开。

在第五集中，林肯和迈克尔成功地从上一季的监狱逃脱，但他们发现自己正被一个神秘组织追捕。为了躲避追捕，他们不得不隐藏起来，并设法弄清楚这个组织的真实目的。在这个过程中，林肯和迈克尔发现了一些关于他们过去的秘密，这些秘密不仅关系到他们自己的命运，还牵扯到他们身边的人。他们开始怀疑，这一切是否都是一个巨大的阴谋，而他们只是其中的棋子。

在第九集中，林肯和迈克尔决定反击，他们开始追踪这个神秘组织，试图找出幕后的黑手。在这个过程中，他们不得不与一些旧友和新伙伴合作，共同对抗这个强大的敌人。然而，随着调查的深入，他们发现这个组织的力量远比他们想象的要强大得多，他们不得不更加小心谨慎。在一次与敌人的交锋中，林肯和迈克尔险些丧命，但最终他们凭借智慧和勇气成功逃脱。

这一季的《越狱》不仅延续了前几季紧张刺激的剧情，还增加了更多的心理战和悬疑元素。林肯和迈克尔的逃亡生活充满了惊险和未知，他们不仅要面对外部的敌人，还要面对内心的挣扎和矛盾。同时，这一季也更加注重人物性格的塑造和内心世界的展现，让观众更加深入地了解这些角色的成长和变化。

总的来说，《越狱》第四季第五集第九集的剧情紧张刺激、扣人心弦，不仅让观众感受到了逃亡的艰辛和危险，还展现了人物之间的情感纠葛和内心挣扎。这一季的成功也为整个系列的结束画上了完美的句号。